Η Διεύθυνση ΚΑΦΕ του Υπουργείου Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων έχει σαν αρμοδιότητα την διερεύνηση θεμάτων Προστασίας ζώων κατά την μεταφορά, διακίνηση, ενσταυλισμό και σφαγή σύμφωνα με το νομοθετικό πλαίσιο που καθορίζεται από τα ΠΔ 344/97 και ΠΔ 327/96 και τις σχετικές εγκυκλίους.